Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 LMNA-201ENST00000347559 3137 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 GPR153-201ENST00000377893 4082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PRNP-203ENST00000430350 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SLC41A3-204ENST00000383598 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TIMP2-201ENST00000262768 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 FAM189A2-201ENST00000257515 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CD79A-201ENST00000221972 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 AC007603.1-201ENST00000563124 2085 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CCSER1Q9C0I3 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
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