Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 RN7SL713P-201ENST00000582127 302 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC020911.1-201ENST00000591038 578 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 RBAK-RBAKDN-201ENST00000396904 766 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 RBAK-RBAKDN-202ENST00000407184 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 STXBP2-221ENST00000602355 716 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CEP44Q9C0F1 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CEP44Q9C0F1 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms