Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C6

CIPC, CLOCK-interacting pacemaker, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPCQ9C0C6 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SEZ6L-209ENST00000529632 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AL163636.1-201ENST00000554286 915 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ABCC10-201ENST00000244533 5088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CHMP2B-205ENST00000494980 1175 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CIPCQ9C0C6 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms