Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 KRT8P31-201ENST00000504812 1408 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 RPS10-207ENST00000621356 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 SERPINB9P1-202ENST00000545177 1375 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CSF3-201ENST00000225474 1509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 GON7-201ENST00000306954 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AL354861.1-201ENST00000445213 355 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 POLD4-206ENST00000530584 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 ADH5-213ENST00000626055 1299 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
FOXQ1Q9C009 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.9 ms