Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZX4

ROPN1B, Ropporin-1B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1BQ9BZX4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ALDH3A1-201ENST00000225740 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZFP64-203ENST00000361387 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 C19orf66-202ENST00000397881 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ARHGEF9-230ENST00000637178 2145 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CROT-203ENST00000419147 2959 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SLC19A1-201ENST00000311124 3811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GATB-201ENST00000263985 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RBBP4-204ENST00000414241 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CHD1L-211ENST00000639534 1144 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AGO3-201ENST00000246314 3211 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ARHGAP36-201ENST00000276211 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GRM1-201ENST00000282753 6622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 LINC02538-201ENST00000609107 4569 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CEP295NL-205ENST00000619342 1866 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 AC068987.4-201ENST00000562343 2094 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 KSR1-216ENST00000582410 2392 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 CALML3-201ENST00000315238 2763 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
ROPN1BQ9BZX4 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.2 ms