Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYR9

KRTAP2-4, Keratin-associated protein 2-4, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP2-4Q9BYR9 RN7SL578P-201ENST00000477781 283 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF7-205ENST00000480908 782 ntTSL 4 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM86JP-202ENST00000484500 988 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 IQSEC2-205ENST00000498281 673 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC099343.1-201ENST00000513481 609 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC090136.2-201ENST00000517809 420 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC104964.1-201ENST00000520494 489 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC024405.2-201ENST00000528459 810 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PPFIBP1-204ENST00000535047 875 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 METTL7AP1-201ENST00000547343 496 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MT3-203ENST00000565838 421 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CARHSP1-208ENST00000567554 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MYMX-201ENST00000573382 817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 Z69706.1-201ENST00000595428 547 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PRR20FP-201ENST00000603320 180 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FAM168A-202ENST00000356467 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KRT18P40-201ENST00000599859 1571 ntBASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KLK4-201ENST00000324041 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GAPDH-205ENST00000396861 1348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC5.46□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AAK1-202ENST00000409068 2606 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GAPDHS-201ENST00000222286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 ELAVL1-205ENST00000596459 1473 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 EFHD1-207ENST00000611312 1490 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF4-216ENST00000511859 1373 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 RNF141-202ENST00000528665 1374 ntTSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC5.45□□□□□ -1.54
KRTAP2-4Q9BYR9 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC5.45□□□□□ -1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.6 ms