Protein–RNA interactions for Protein: Q9BX26

SYCP2, Synaptonemal complex protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP2Q9BX26 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 POLR1E-202ENST00000377798 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC114763.1-201ENST00000431985 928 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 LINC01029-204ENST00000583106 1465 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 CNRIP1-202ENST00000409559 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 LINC02557-201ENST00000432249 477 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 SARS2-202ENST00000430193 1886 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 BAK1P1-201ENST00000317045 636 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 SUMF2-210ENST00000437307 947 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TIMP1-205ENST00000456754 1095 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SYCP2Q9BX26 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms