Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 DRC3-202ENST00000399182 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 ALPL-207ENST00000540617 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 CRABP1-201ENST00000299529 772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 LINC01694-201ENST00000424569 821 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AL008638.5-201ENST00000623814 1298 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 MAD1L1-203ENST00000402746 2355 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 DCBLD1-202ENST00000338728 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 NME6-203ENST00000415644 849 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AC092944.1-202ENST00000487238 483 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 RPS15-202ENST00000585665 467 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AC245123.1-202ENST00000612422 1719 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 CAP2-206ENST00000489374 1430 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
APOL6Q9BWW8 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms