Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 STARD8-202ENST00000374597 4820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 MFNG-202ENST00000416983 2034 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 TNRC18-203ENST00000399537 10572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 TNRC18-205ENST00000430969 10562 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RBBP8Q99708 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 DNAJC27-201ENST00000264711 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ING4-202ENST00000396807 1393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RBBP8Q99708 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 PCNX4-203ENST00000406854 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 DOC2GP-202ENST00000514950 1163 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RBBP8Q99708 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms