Protein–RNA interactions for Protein: Q99627

COPS8, COP9 signalosome complex subunit 8, humanhuman

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS8Q99627 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 GNLY-210ENST00000524600 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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COPS8Q99627 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 PDIA4-201ENST00000286091 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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COPS8Q99627 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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COPS8Q99627 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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COPS8Q99627 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
COPS8Q99627 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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COPS8Q99627 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 SEMA5B-201ENST00000195173 4523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
COPS8Q99627 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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