Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TNNT2-209ENST00000421663 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AL845331.2-201ENST00000561882 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ELOF1-202ENST00000586120 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 OXNAD1-202ENST00000435829 1643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 DNM1P30-201ENST00000563586 452 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 CAB39-201ENST00000258418 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TLE4-204ENST00000376537 2793 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 FKBP9-214ENST00000538336 3621 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 WASHC3-201ENST00000240079 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 IGLJ3-201ENST00000390324 176 ntAPPRIS P1 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 LINC01237-201ENST00000415434 573 ntTSL 4 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SNHG14-213ENST00000551077 638 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 HIGD1A-202ENST00000418900 1322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 CTBP1-209ENST00000510568 4250 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ZFP36-203ENST00000597629 1786 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
PCNX1Q96RV3 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
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