Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT7

C9orf72, Guanine nucleotide exchange C9orf72, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf72Q96LT7 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AICDA-201ENST00000229335 2819 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CDKL3-206ENST00000521118 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CDYL-205ENST00000449732 2139 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 WNT3A-201ENST00000284523 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 FYTTD1-201ENST00000241502 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AL161781.2-201ENST00000509911 739 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AP006621.2-201ENST00000533938 284 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 NAXD-201ENST00000309957 2659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RUSC1-204ENST00000368352 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 GAS2L2-202ENST00000604641 3014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ICA1-207ENST00000406470 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 TSPAN11-201ENST00000261177 5505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 WAC-AS1-202ENST00000528337 2608 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
C9orf72Q96LT7 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms