Protein–RNA interactions for Protein: Q96FJ0

STAMBPL1, AMSH-like protease, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPL1Q96FJ0 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 TNFRSF11A-205ENST00000616710 3809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 PITPNM1-216ENST00000534749 4189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 ABLIM2-213ENST00000514025 2974 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC063926.2-201ENST00000623766 1308 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 GDPD2-204ENST00000536730 2171 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 TCAF1P1-201ENST00000414990 2232 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 SF1-201ENST00000227503 2850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 CARHSP1-216ENST00000610831 2841 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 ARL10-201ENST00000310389 10845 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 ZNF782-205ENST00000481138 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 FBXL19-201ENST00000338343 3965 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 C2orf40-201ENST00000238044 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STAMBPL1Q96FJ0 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms