Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 CHMP1A-202ENST00000535997 2295 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 KHK-201ENST00000260598 2397 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 NDUFS7-203ENST00000414651 841 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC104961.2-201ENST00000578129 663 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC010422.5-201ENST00000597961 585 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 ASNSD1-206ENST00000607062 968 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 TXNDC5-204ENST00000473453 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 METTL17-201ENST00000339374 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 LCMT1-203ENST00000399069 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 SPIN2B-203ENST00000374910 725 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 PDCD5-202ENST00000379316 154 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 CHCHD2-201ENST00000395422 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC006455.8-201ENST00000451381 351 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC020659.1-202ENST00000564432 531 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 PDCD5-208ENST00000592786 468 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC011462.2-201ENST00000598887 344 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 HIST1H3F-201ENST00000618052 411 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
SIRT1Q96EB6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 U2AF1L4-201ENST00000292879 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RNASE10-201ENST00000328444 717 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 MIR645-201ENST00000385283 94 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 FXYD2-205ENST00000528014 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC011481.2-201ENST00000585408 426 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SIRT1Q96EB6 MCM7-202ENST00000343023 1968 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms