Protein–RNA interactions for Protein: Q96B33

CLDN23, Claudin-23, humanhuman

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Length 292 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN23Q96B33 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 TNFSF11-201ENST00000239849 911 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CLDN23Q96B33 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 HCG27-204ENST00000424675 895 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RPL35P9-201ENST00000446059 350 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CLDN23Q96B33 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CLDN23Q96B33 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CLDN23Q96B33 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AC068025.1-201ENST00000577218 762 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CLDN23Q96B33 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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CLDN23Q96B33 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN23Q96B33 TNFRSF1A-202ENST00000366159 1339 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN23Q96B33 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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CLDN23Q96B33 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 SLC6A9-207ENST00000475075 1881 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
CLDN23Q96B33 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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