Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 EIF3G-201ENST00000253108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RHOQP1-201ENST00000555758 579 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 DIO1-215ENST00000610607 796 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC013355.1-201ENST00000562625 723 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CHIA-206ENST00000430615 1320 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 FGD1-201ENST00000375135 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 H2AFV-206ENST00000437072 589 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RNA5SP486-201ENST00000515961 83 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PSENEN-203ENST00000591949 833 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AL390755.1-201ENST00000623716 2027 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 VILL-202ENST00000383759 2787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 FGD5P1-202ENST00000614866 2498 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
PHF3Q92576 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms