Protein–RNA interactions for Protein: Q902F9

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113Q902F9 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC114296.1-204ENST00000637197 1173 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CDC45-202ENST00000404724 1693 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 GUSBP10-201ENST00000417412 665 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TMIGD2-204ENST00000600349 333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 RELL1-201ENST00000314117 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 RANBP1-208ENST00000430524 1389 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 TNNT2-203ENST00000367315 1083 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 MAPK3-204ENST00000395200 997 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 HNRNPA1P27-201ENST00000412087 955 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 OR2T27-202ENST00000460972 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 AL022334.2-201ENST00000610000 484 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
HERVK_113Q902F9 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms