Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBB5

KLHDC4, Kelch domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 520 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC4Q8TBB5 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 GSTT2B-201ENST00000290765 1099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 TMEM208-207ENST00000563953 887 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 E2F6-211ENST00000542100 3450 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 FOS-201ENST00000303562 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 GCOM2-201ENST00000509133 1104 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 CRHR1-208ENST00000577353 1206 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SLC35A3-209ENST00000638338 2890 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 PRDX5-203ENST00000352435 596 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 NKAIN1P1-201ENST00000435754 582 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 APOPT1-207ENST00000477116 906 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 OARD1-212ENST00000482515 832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ORAOV1-211ENST00000542341 775 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
KLHDC4Q8TBB5 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms