Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAS9

C5orf17, Uncharacterized protein C5orf17, humanhuman

Predictions only

Length 161 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf17Q8NAS9 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TP73-201ENST00000346387 4854 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 HNRNPH3-201ENST00000265866 2339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 GOLGA8VP-201ENST00000559009 1798 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 RNF216-205ENST00000425013 5639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SC5D-202ENST00000392789 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 MUC1-223ENST00000611571 4170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 LAMA3-202ENST00000313654 10661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SAMD4A-201ENST00000251091 6565 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PKP1-203ENST00000367324 5384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SLC46A1-208ENST00000618626 5363 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 USP6NL-205ENST00000609104 11377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PTPA-205ENST00000357197 2653 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 GRIK5-201ENST00000262895 3493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 MAP3K4-203ENST00000366920 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 GPRASP1-202ENST00000415986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 CFAP52-202ENST00000396219 1912 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC009065.5-201ENST00000565937 596 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 GOLGA2-215ENST00000639983 1038 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 NFATC2-203ENST00000414705 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SMTN-202ENST00000347557 3130 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 TNFRSF1B-201ENST00000376259 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
C5orf17Q8NAS9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 PASK-201ENST00000234040 4572 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
C5orf17Q8NAS9 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.8 ms