Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4P3

HDDC3, Guanosine-3',5'-bis(diphosphate) 3'-pyrophosphohydrolase MESH1, humanhuman

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Length 179 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDDC3Q8N4P3 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 EXOC7-213ENST00000467929 2260 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
HDDC3Q8N4P3 SST-201ENST00000287641 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 AKIP1-201ENST00000299576 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 GATD1-203ENST00000397472 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 AP003419.2-201ENST00000543494 711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.05■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.05■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC15.04■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 AL358472.3-201ENST00000608147 415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
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HDDC3Q8N4P3 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
HDDC3Q8N4P3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
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