Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWD4

CCDC117, Coiled-coil domain-containing protein 117, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC117Q8IWD4 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LRCH3-206ENST00000438796 7394 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AL163974.1-201ENST00000554540 466 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 BAIAP3-216ENST00000628027 4732 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 DLGAP1-204ENST00000400149 5203 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AL354989.2-201ENST00000435838 1540 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC013726.1-201ENST00000563747 2285 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 XPO7-201ENST00000252512 4861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 DAAM2-201ENST00000274867 6194 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SIX4-201ENST00000216513 6285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CCDC117Q8IWD4 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.3 ms