Protein–RNA interactions for Protein: Q86X40

LRRC28, Leucine-rich repeat-containing protein 28, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 367 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC28Q86X40 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PLK2-201ENST00000274289 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 FAM219A-209ENST00000445726 3644 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 CCDC186-202ENST00000369286 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC008894.2-201ENST00000597983 2987 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 SLC35C2-201ENST00000243896 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 ITGB2-203ENST00000355153 2913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 NXPH1-201ENST00000405863 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AL353803.2-201ENST00000436510 1846 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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LRRC28Q86X40 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 BLK-201ENST00000259089 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 RPS6KA4-202ENST00000528057 3121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
LRRC28Q86X40 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
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