Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTN6

STRADA, STE20-related kinase adapter protein alpha, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADAQ7RTN6 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 AL035252.4-201ENST00000624174 288 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 TM4SF19-203ENST00000446879 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 AL136172.1-201ENST00000598590 1394 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
STRADAQ7RTN6 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 212.1 ms