Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AL591623.1-201ENST00000417786 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 FGFR3-203ENST00000352904 3733 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PSMD13-203ENST00000431206 1591 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 LINC01595-201ENST00000555406 639 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 FOXRED2-204ENST00000397224 4967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CENPPQ6IPU0 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.9 ms