Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXD3

SAMD13, Sterile alpha motif domain-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD13Q5VXD3 ZBTB11-201ENST00000312938 6020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PNPLA6-201ENST00000221249 4617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 DENND3-202ENST00000424248 4740 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 THOC5-203ENST00000397872 2676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 U52111.1-201ENST00000434284 914 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC009163.1-201ENST00000530512 573 ntTSL 4 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TRAK1-201ENST00000327628 5293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TATDN3-202ENST00000366974 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SLC35D1-201ENST00000235345 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 C5orf56-206ENST00000612967 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SLC22A23-202ENST00000380302 2883 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 FAAP100-202ENST00000425898 2996 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 PTPRK-204ENST00000368210 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 USP22-201ENST00000261497 5220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SUCO-202ENST00000367723 5916 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ARHGEF26-203ENST00000465817 2353 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CRTC1-202ENST00000338797 6929 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ZNF79-201ENST00000342483 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 CHRDL1-204ENST00000444321 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 GUF1-201ENST00000281543 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 ATP1A1-AS1-202ENST00000369492 1011 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
SAMD13Q5VXD3 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms