Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 RN7SL582P-201ENST00000491078 279 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 C21orf33-202ENST00000348499 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PGAP2-227ENST00000496834 1530 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 WASIR1-201ENST00000399966 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MT1G-203ENST00000568675 628 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 EEF1DP7-201ENST00000580496 513 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC021321.1-201ENST00000607397 1113 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 DHRS7-209ENST00000557185 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TBC1D17-202ENST00000535102 2025 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 RNVU1-8-201ENST00000364272 125 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 LINC01029-202ENST00000578833 366 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 FBXO36P1-201ENST00000579006 471 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 HLF-202ENST00000430986 1385 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ATP5A1-201ENST00000282050 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SPATC1-202ENST00000447830 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 SNRPC-201ENST00000244520 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 IL37-204ENST00000352179 709 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 LINC01022-201ENST00000415652 394 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC004889.1-205ENST00000493248 531 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 OR2A1-AS1-210ENST00000496968 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 STAU2-212ENST00000521419 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AAMDC-207ENST00000527134 693 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 AP003785.1-201ENST00000544959 492 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 RN7SL121P-201ENST00000584223 273 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 ANXA8L1-202ENST00000611655 1398 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LAMA3Q16787 GRID2IP-201ENST00000435185 3215 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 TPT1P6-201ENST00000458298 514 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AL160191.2-201ENST00000603975 601 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CBR3-AS1-206ENST00000608632 659 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC006986.1-201ENST00000612764 241 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC015912.3-201ENST00000619432 348 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC005865.2-202ENST00000635814 725 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC010096.1-201ENST00000443897 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 IKBKB-223ENST00000522147 954 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 LY6E-215ENST00000523847 427 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SPAG5-AS1-204ENST00000556050 871 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 NF1P11-201ENST00000621292 1282 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
LAMA3Q16787 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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