Protein–RNA interactions for Protein: Q16531

DDB1, DNA damage-binding protein 1, humanhuman

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Length 1,140 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDB1Q16531 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AP000552.1-203ENST00000416615 1930 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 GDPGP1-201ENST00000329600 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 COX20P1-201ENST00000366529 357 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 CXCL12-205ENST00000395794 1052 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC156455.1-203ENST00000423999 893 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC019118.2-201ENST00000425776 718 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ATP1A4-205ENST00000470705 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 DGAT2L7P-201ENST00000602462 744 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 DUSP22-213ENST00000605035 1231 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 NAMA-206ENST00000605377 509 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC018695.6-201ENST00000614011 534 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 CASP16P-204ENST00000635032 809 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC069208.1-205ENST00000456299 576 ntTSL 4 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 PGAM1P12-201ENST00000505622 748 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC068867.1-201ENST00000559855 150 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC134312.2-201ENST00000563521 608 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC002044.2-201ENST00000624910 970 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 AC021305.1-201ENST00000520656 1514 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DDB1Q16531 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 AC016757.1-202ENST00000409376 892 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 NUPL2-202ENST00000410002 680 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
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DDB1Q16531 AC012073.1-201ENST00000606114 1108 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 SGCA-201ENST00000262018 1432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CRYL1-201ENST00000298248 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DDB1Q16531 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
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