Protein–RNA interactions for Protein: Q15650

TRIP4, Activating signal cointegrator 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP4Q15650 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AL162457.2-202ENST00000442888 679 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 UBR5-201ENST00000220959 9418 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 TFAP2C-201ENST00000201031 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 OPA1-203ENST00000361715 6384 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 KLK1-201ENST00000301420 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 CYGB-203ENST00000589145 788 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AC114737.3-201ENST00000636708 570 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
TRIP4Q15650 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms