Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

Predictions only

Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AQP7P3-201ENST00000624547 1041 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ASB3-202ENST00000394717 1734 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 LY86-201ENST00000230568 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 C11orf49-203ENST00000378618 1166 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 RPA3-202ENST00000396682 847 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 FAM92A-202ENST00000423990 914 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 DPY19L2P5-201ENST00000456300 331 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC106047.2-201ENST00000511723 743 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 IGHEP1-201ENST00000521393 651 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 FAM86B3P-203ENST00000523992 854 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC107871.2-202ENST00000563057 396 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 CSTF3-202ENST00000431742 715 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL135901.1-201ENST00000451812 333 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MRPS36-204ENST00000512880 1200 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC114947.1-202ENST00000514136 344 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MRPS36-205ENST00000602380 1200 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AZGP1-202ENST00000411734 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ZMYND10-202ENST00000360165 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 KLK11-203ENST00000391804 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC008050.1-201ENST00000554926 632 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 SPAG6-201ENST00000313311 2421 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC004554.1-201ENST00000422830 1468 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 AC104758.3-201ENST00000563349 1453 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 CDSN-202ENST00000376288 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
SHPRHQ149N8 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
SHPRHQ149N8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
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