Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 C2orf70-201ENST00000329615 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 PHACTR1-203ENST00000379335 943 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 CYB561D1-203ENST00000393709 620 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 ASGR2-203ENST00000446679 879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 APOC4-202ENST00000592954 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 HOXD3-202ENST00000410016 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 TRAPPC3-201ENST00000373159 590 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 BANF1P3-201ENST00000412556 261 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 SLC25A3-216ENST00000551917 1359 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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CHD4Q14839 TXNL4B-203ENST00000426362 965 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CHD4Q14839 MYL6-218ENST00000550697 901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CHD4Q14839 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
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CHD4Q14839 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 RBFOX3-206ENST00000582043 1143 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AP000229.1-202ENST00000609365 559 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CHD4Q14839 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
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