Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 214 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 KCNJ5-202ENST00000529694 5940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PRRG1-203ENST00000463135 1663 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CEP135-202ENST00000422247 2092 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ENTPD4-202ENST00000358689 5861 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 IRF2BPL-201ENST00000238647 4157 ntAPPRIS P1 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ZYG11A-201ENST00000371528 4469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FOXK1-201ENST00000328914 11181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 VDR-201ENST00000229022 4773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TNRC6C-205ENST00000588061 8419 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.72□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 RRBP1-201ENST00000246043 4737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ST8SIA1-203ENST00000396037 9714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CYP2R1-207ENST00000532378 1746 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MKL1-201ENST00000355630 4496 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FAM155A-201ENST00000375915 8503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SEPT6-201ENST00000343984 2693 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 INHBA-201ENST00000242208 6064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 SENP3-202ENST00000429205 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 FBXO34-201ENST00000313833 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
SMCO1Q147U7 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GPR161-209ENST00000539777 7655 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SPATS2-203ENST00000547865 1810 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PABPC1-208ENST00000519004 2401 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ZEB2-204ENST00000409487 5361 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TBC1D17-201ENST00000221543 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TBC1D17-209ENST00000622860 2370 ntTSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 MKL1-203ENST00000402042 4343 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 RHOH-224ENST00000622175 2254 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 UBE2D3-210ENST00000453744 3990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 ESPNL-202ENST00000409169 4441 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 STRIP2-201ENST00000249344 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 KIF21B-202ENST00000360529 5389 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 USP24-201ENST00000294383 10549 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 NTSR1-201ENST00000370501 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 CARHSP1-217ENST00000611932 2833 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
SMCO1Q147U7 EIF4G1-205ENST00000382330 5129 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
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