Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 NPFF-201ENST00000267017 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 OBSCN-AS1-201ENST00000295012 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AL020996.1-201ENST00000442055 435 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 FBXO16-202ENST00000380254 1343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 HBB-201ENST00000335295 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PTTG1IP-202ENST00000397886 755 ntTSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 OR8T1P-201ENST00000421347 918 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 C17orf58-202ENST00000449250 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AL589740.1-203ENST00000433637 1984 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 FMR1-215ENST00000616382 1648 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PSME2-201ENST00000216802 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AL691482.3-201ENST00000504773 987 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC015917.2-201ENST00000580714 493 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC093567.1-201ENST00000590649 877 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ZNF530-203ENST00000597864 634 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 KIR3DL2-201ENST00000270442 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 PYY2-201ENST00000315776 282 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
PTCH1Q13635 COX14-201ENST00000317943 708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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