Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

Predictions only

Length 759 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AP001002.3-201ENST00000623482 206 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 GGT5-202ENST00000327365 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CLN3-229ENST00000567963 1452 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ANXA9-201ENST00000368947 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC008125.1-201ENST00000548488 1538 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 Z82198.1-201ENST00000447396 437 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SUOX-204ENST00000394115 2394 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ANO10-205ENST00000414522 2450 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CPN2-202ENST00000429275 2008 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 PRR30-201ENST00000335524 2008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ARMCX1-201ENST00000372829 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ETV4-203ENST00000538265 2147 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 GP1BA-202ENST00000611961 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC023794.5-201ENST00000564380 2157 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC112229.3-201ENST00000603767 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AC013271.1-201ENST00000640669 3202 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
CUL4AQ13619 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
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