Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TCAM1P-207ENST00000485295 1537 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 LINC01873-201ENST00000428647 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 CSF1-201ENST00000329608 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 ZFYVE28-210ENST00000515169 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CUL1Q13616 RBP1-203ENST00000483943 1935 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 RRAGB-202ENST00000374941 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PTENP1-202ENST00000532280 3996 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 DOK1-202ENST00000340004 1722 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SPIN3-204ENST00000638257 4835 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 MAPT-IT1-201ENST00000624111 3016 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 IGHG3-202ENST00000641136 2751 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 HIF3A-202ENST00000244303 2250 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL1Q13616 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
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