Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

Predictions only

Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 DKKL1P1-201ENST00000400550 698 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TAGLN3-203ENST00000455401 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC093510.1-202ENST00000546238 442 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 KCNN2-201ENST00000264773 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 BAX-205ENST00000391871 687 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC015691.1-201ENST00000394793 535 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AL359458.1-201ENST00000430821 400 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MAGEA7P-201ENST00000436482 942 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PRKCZ-AS1-202ENST00000444529 622 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 LINC01598-205ENST00000508763 719 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 APOPT1-215ENST00000556253 783 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC135782.2-201ENST00000562040 472 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 AC006116.2-201ENST00000589958 988 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MIEF1-215ENST00000637854 213 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ZNF436-AS1-201ENST00000335648 2547 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
ATRQ13535 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 VEGFA-201ENST00000230480 993 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PTGER4P2-201ENST00000328411 252 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 UQCC2-201ENST00000374214 432 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CASP2-203ENST00000392925 616 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PTGER4P3-201ENST00000458150 252 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 ADAMTS9-AS1-216ENST00000626280 882 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
ATRQ13535 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ECH1-201ENST00000221418 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 SUCLA2-205ENST00000470760 1445 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 LIMS2-209ENST00000410038 1695 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CSHL1-201ENST00000259003 739 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AL357833.1-201ENST00000413993 832 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AC098657.1-201ENST00000416270 1135 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 CSHL1-206ENST00000450719 973 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 GNG10P1-201ENST00000452289 199 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
ATRQ13535 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
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