Protein–RNA interactions for Protein: Q13461

FOXE3, Forkhead box protein E3, humanhuman

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXE3Q13461 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 FLAD1-201ENST00000292180 2160 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 LRRN1-201ENST00000319331 3823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AP3M2-201ENST00000174653 3661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 KDM3A-203ENST00000409556 4928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 USP28-214ENST00000545540 3431 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NRCAM-217ENST00000613830 3025 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SIRPB2-203ENST00000444444 884 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 AC068580.4-201ENST00000636615 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
FOXE3Q13461 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms