Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SLC7A8-212ENST00000529705 1819 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 ASAH1-258ENST00000637790 3042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
XRCC4Q13426 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TTC28-AS1-212ENST00000433317 3080 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LINC01138-206ENST00000622328 2212 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SLC7A15P-201ENST00000424028 1363 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 DSN1-207ENST00000448110 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 LEPROTL1-202ENST00000442880 908 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 UBTF-201ENST00000302904 4997 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SGK2-204ENST00000373100 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 FBP1-203ENST00000415431 1487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MLXIPL-203ENST00000354613 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 SIGLECL1-208ENST00000614422 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MBD4-204ENST00000503197 2099 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 TC2N-206ENST00000556018 1770 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 UBB-201ENST00000302182 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 DERL3-204ENST00000406855 1063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 NEIL2-207ENST00000528323 998 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
XRCC4Q13426 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
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