Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

Predictions only

Length 1,112 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC114501.1-201ENST00000445949 172 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 RBFOX2-201ENST00000262829 1538 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 LBH-202ENST00000401506 485 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 EVA1A-204ENST00000410071 777 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC104784.1-201ENST00000473096 294 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CNTFR-204ENST00000610543 1926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ZNF384-202ENST00000355772 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
PDE3BQ13370 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 ZCCHC4-206ENST00000612982 938 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
PDE3BQ13370 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
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