Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AL354877.1-201ENST00000424412 413 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PLEKHB1-206ENST00000535129 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC093525.1-201ENST00000569317 596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 NCK2-203ENST00000393349 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AL359915.2-205ENST00000418015 1529 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ENDOU-203ENST00000545824 1513 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 FAM24B-202ENST00000368898 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 MIR1247-201ENST00000408206 136 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC131206.1-201ENST00000538078 1211 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 NOSIP-201ENST00000339093 1000 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 TREML1-201ENST00000373127 1194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 SMS-201ENST00000379404 1174 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
ITGB3BPQ13352 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms