Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 PTBP1-203ENST00000356948 3598 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 CAVIN1-201ENST00000357037 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 CDT1-201ENST00000301019 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
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SLAMF1Q13291 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 UNC13B-203ENST00000396787 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 TOP3B-201ENST00000357179 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
SLAMF1Q13291 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
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