Protein–RNA interactions for Protein: Q13111

CHAF1A, Chromatin assembly factor 1 subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHAF1AQ13111 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 FDPS-221ENST00000612683 1198 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC005695.3-201ENST00000614522 232 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 FARP1-214ENST00000595437 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ISLR-201ENST00000249842 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 MRPL34-201ENST00000252602 968 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 IGHV3-53-201ENST00000390627 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AURKB-202ENST00000534871 1167 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC120498.1-201ENST00000563593 476 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 SCN1B-204ENST00000596348 1176 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 GPS1-227ENST00000623761 1943 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 TERT-201ENST00000310581 4018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHAF1AQ13111 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TEX13C-201ENST00000632600 5095 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 ATXN2L-202ENST00000336783 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHAF1AQ13111 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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