Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PAIP2-201ENST00000265192 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CCL18-201ENST00000616054 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SGCE-204ENST00000428696 1409 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PRTFDC1-202ENST00000376376 741 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TRBJ2-6-201ENST00000390418 53 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 VENTXP4-201ENST00000449029 958 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 IGHEP2-201ENST00000519308 1256 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CDH23-201ENST00000224721 11139 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CDH23-214ENST00000622827 11122 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 UQCC2-204ENST00000607484 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TPM4-202ENST00000344824 1417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PPIL6-202ENST00000424445 4031 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC013553.1-201ENST00000560906 267 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MT2A-202ENST00000561491 581 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC008825.2-201ENST00000603374 718 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 RPF1-201ENST00000370654 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SEC13-209ENST00000397117 1603 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PIFO-201ENST00000369737 746 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 HNRNPABP1-201ENST00000406003 734 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LINC02063-201ENST00000503415 566 ntTSL 4 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 HNRNPA1P16-201ENST00000575692 955 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC145343.1-201ENST00000579629 650 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC008906.2-201ENST00000606656 474 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ERICH1-206ENST00000522706 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
PTPN13Q12923 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
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