Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AADAT-206ENST00000509167 2113 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AC087620.1-201ENST00000520037 447 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AC023825.2-201ENST00000562970 672 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SELENOW-212ENST00000601048 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AC011462.4-201ENST00000616866 449 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 IDH3A-224ENST00000629769 114 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 C12orf65-204ENST00000429587 1326 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 CTSV-201ENST00000259470 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 ODCP-201ENST00000459650 1639 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 NCF4-201ENST00000248899 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 PGLYRP3-201ENST00000290722 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 MKRN3-201ENST00000314520 2337 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 TMEM9-203ENST00000367333 1564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 BIN3-202ENST00000399977 1340 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 LINC01983-201ENST00000413586 574 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 OR52M2P-201ENST00000414298 959 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 RUFY1-204ENST00000437570 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 CRADD-205ENST00000548483 1056 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AP005264.5-201ENST00000590066 467 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 MAGEA2-203ENST00000611557 2024 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 Metazoa_SRP.127-201ENST00000614914 302 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SERPINA1-209ENST00000449399 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SEC13-202ENST00000350697 1425 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 TNNT3-201ENST00000278317 1210 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 HNRNPA1-201ENST00000330752 1294 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 LST1-204ENST00000376086 554 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 TNNT3-207ENST00000381589 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 PLA2G2A-202ENST00000400520 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 LINC00339-202ENST00000416769 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AL035413.1-201ENST00000437898 507 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AC092896.1-201ENST00000465850 380 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 RORA-AS1-201ENST00000501579 761 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AC008735.2-201ENST00000589456 549 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AP000357.2-201ENST00000633827 597 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 NBPF3-205ENST00000454000 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 ARL1-202ENST00000536227 1322 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 HIST1H4B-201ENST00000377745 438 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AL121983.2-202ENST00000419983 535 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 BCRP4-201ENST00000506079 804 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AC087269.1-202ENST00000519147 400 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 EHF-208ENST00000530286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 TNNI1-205ENST00000555948 580 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GRIN2AQ12879 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56 ms