Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AGRN-210ENST00000620552 7394 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 MYLK-203ENST00000359169 7585 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RSPH3-201ENST00000252655 2175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
STX4Q12846 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 REPIN1-201ENST00000397281 3292 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RNFT2-203ENST00000392549 2896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC005229.1-201ENST00000392885 409 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 BCRP2-202ENST00000447763 634 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC14.28□□□□□ -0.12
STX4Q12846 BCRP6-201ENST00000510112 632 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms