Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 ACE-201ENST00000290863 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 DYRK1A-203ENST00000398956 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 IFITM2-204ENST00000533141 588 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AC004466.1-201ENST00000599515 1080 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PREP-201ENST00000369110 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 RDX-218ENST00000544551 4117 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
KCNH2Q12809 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 SNX14-202ENST00000346348 3348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 LINC00266-1-201ENST00000279067 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 DGCR5-201ENST00000399539 862 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 TNFRSF10A-AS1-201ENST00000518308 637 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 LACTB2-203ENST00000522447 1034 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 AC108134.1-201ENST00000382225 3061 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
KCNH2Q12809 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
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