Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AAMP-202ENST00000420660 1761 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 UBA1-201ENST00000335972 3559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
APOBRQ0VD83 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms