Protein–RNA interactions for Protein: Q03060

CREM, cAMP-responsive element modulator, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREMQ03060 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ESD-202ENST00000378720 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ANKDD1A-203ENST00000395723 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC011773.1-201ENST00000520129 468 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 AC005962.1-201ENST00000584100 773 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 IRF3-215ENST00000596822 823 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CREMQ03060 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CREMQ03060 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CAPN3-207ENST00000397200 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PTPA-215ENST00000432124 567 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 SRSF10-211ENST00000484146 1089 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PGRMC2-206ENST00000512483 1144 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 C12orf73-211ENST00000553183 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CREMQ03060 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms