Protein–RNA interactions for Protein: Q01804

OTUD4, OTU domain-containing protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTUD4Q01804 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 POU5F1B-201ENST00000465342 5360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CLK4-201ENST00000316308 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 C4A-259ENST00000498271 5269 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PRAP1-201ENST00000433452 971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 IL21R-AS1-201ENST00000563191 2615 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KIAA0895L-202ENST00000561621 3500 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KCNK7-201ENST00000340313 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 SMIM22-211ENST00000615889 1047 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 KDM2B-201ENST00000377069 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 INHBE-201ENST00000266646 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 NFS1-203ENST00000374092 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
OTUD4Q01804 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45 ms