Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 NSD1-211ENST00000511258 809 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 TMEM126A-203ENST00000528105 656 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ZNF124-206ENST00000543802 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC136944.4-201ENST00000568893 660 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
SCN7AQ01118 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TEKT4P2-202ENST00000559466 1312 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AL591122.2-201ENST00000624125 1853 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 BTNL8-211ENST00000610640 1488 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AURKB-201ENST00000316199 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AC108734.2-201ENST00000420887 1069 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AL355803.1-201ENST00000455524 188 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 SH3GLB2-205ENST00000416629 1415 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 ILF2-201ENST00000361891 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 KRTAP1-3-201ENST00000344363 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TMEM216-202ENST00000398979 908 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 PPOX-204ENST00000462866 473 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AC095040.1-201ENST00000513286 675 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 PRR7-AS1-204ENST00000514846 543 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 RN7SL357P-201ENST00000581065 298 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 ZIM2-AS1-201ENST00000595954 2129 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AC010976.2-201ENST00000609697 852 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 MS4A15-201ENST00000337911 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 S100A3-202ENST00000368713 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 AC073592.2-201ENST00000623062 780 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 FAM69C-202ENST00000400291 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 LINC02021-201ENST00000504808 1608 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
SCN7AQ01118 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms