Protein–RNA interactions for Protein: Q00987

MDM2, E3 ubiquitin-protein ligase Mdm2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MDM2Q00987 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 UCHL1-207ENST00000508768 827 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 DGCR5-204ENST00000440005 1299 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 LINC02281-201ENST00000549013 375 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 LEF1-216ENST00000510624 1472 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 C21orf58-204ENST00000397682 2941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 STBD1-201ENST00000237642 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AMT-204ENST00000427987 1646 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MON2-201ENST00000393629 5612 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 PGBD5-202ENST00000525115 1569 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC008438.1-201ENST00000507521 549 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC124301.1-201ENST00000524885 602 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
MDM2Q00987 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms